Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji

Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji

Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 2009 yılında kurulmuştur, 2010 yılında faaliyete geçmiştir ve halen Fen Fakültesi bünyesinde çalışmalarını sürdürmektedir. Anabilim Dalı Başkanlığı’nı 2010-2025 yılları arasında emekli öğretim üyesi Prof. Dr. Ece ŞEN yürütmüştür. 2025 yılı itibari ile Anabilim Dalı Başkanlığı’nı Prof. Dr. Burhan ŞEN’in yürüttüğü Anabilim Dalında görev yapan 1 öğretim üyesi (Prof. Dr. Burhan ŞEN) ve 1 öğretim elemanı ( Araş. Gör. Dr. Deniz YÜKSEL YENCE) bulunmaktadır.

Araştırma Konularımız

Nanoteknoloji, biyoteknoloji, gıda kökenli patojenlerin tespiti, antibiyotik direnci, biyofilm, mikroorganizmaların moleküler identifikasyonu, Caenorhabditis elegans model sistemi kullanarak in vivo antimikrobiyal aktivite belirleme

Laboratuvar Donanımımız:

Biyolojik emniyet kabini, PZR cihazı, horizontal midi jel elektroforez cihazı, güç kaynağı, inkübatör, koloni sayacı, Ph metre, mikrosantrifüj, vorteks, sıcak su banyosu, elektrikli insineratör/sterilizatör, PZR sterilizasyon kabini, immünoblotting transfer cihazı, steril hücre kültürü ve biyolojik emniyet düzeyi 2 izolasyon odası. , invert faz kontrast ışık mikroskopu, karanlık alan ışık mikroskopu ve kamera/video ataçmanları, karbondioksitli etüv, bakteriyolojik etüv, HEPA filtreli deney hayvanı kafes sistemleri

Bilimsel Yayınlar (Son 5 yıla ait)

Göger G, Şengel SB, Yüksel Yence D, (2025) Preparation of nano(micro)particles from Cotinus coggygria Scop. extracts and investigation of their antimicrobial effects in vivo Caenorhabditis elegans model, Microbial Pathogenesis, https://doi.org/10.1016/j.micpath.2025.107303. (SCI-SCI Exp Q2)

Yavaş, S. T., Yüksel Yence, D. & Şen, E. (2025) Hydrochloric Acid Application Improves the Detection of Salmonella spp. and Escherichia coli O157: H7 in Food Samples. Kirklareli University Journal of Engineering and Science, 11(1), 1-10. (Alan endeksi)

POLAT İ, ŞEN B, KAYNAK ONURDAĞ F (2024). Salmonella enterica serotypes isolated for the first time in laying hens, and their susceptibility to antibiotics. POULTRY SCIENCE, Doi: 10.1016/j.psj.2023.103180. (SCI-SCI Exp Q1)

Göger G, Yüksel D, Göger F, Köse YB, Demirci F. (2024) Antimicrobial evaluation of Tripleurospermum callosum (Boiss. & Heldr.) E. Hossain extracts using in vitro and in vivo Caenorhabditis elegans model against urinary system pathogens. Int J Environ Health Res. 2024 Mar;34(3):1466-1478. doi: 10.1080/09603123.2023.2221641. Epub 2023 Jun 8. PMID: 37288869. (SCI-SCI Exp Q2)

Yüksel, D., Şen, E. (2023) Antibiotic resistance and biofilm forming abilities of Listeria monocytogenes and effect of subMIC concentration of white vinegar on these virulence factors. Acta Alimentaria, An International Journal of Food Science (https://doi.org/10.1556/066.2022.00239) (SCI-SCI Exp Q4)

Aksoy (Yüksel Yence), D. (2021) Microbiological Quality Aspects of Ready to Eat Foods with Focus on Antibiotic Resistance and Biofilm Formation Abilities of Foodborne Bacteria, Acta Alimentaria, An International Journal of Food Science (doi:https://doi.org/10.1556/066.2021.00061) (SCI-SCI Exp Q4)

ÖKTEN S, ŞEN B, KAYNAK ONURDAĞ F, KOLUKIRIK M, ASAN A (2020) Is new generation sequencing an alternative to cultivation based methods for investigating fungal diversity in indoor air samples?. Aerobiologia, 36(3), 433-440., Doi: https://doi.org/10.1007/s10453-020-09642-y (SCI-SCI Exp Q3)

Tikveşli M, ASAN A,GÜRCAN Ş, ŞEN B (2020) Fungal biodiversity on slippers and carpets dusts in three mosques of Edirne City, Turkey (Türkiye’de Edirne şehrinin üç camisinde halı tozları ve terliklerde mantar biyoçeşitliliği).       Mantar Dergisi – The Journal of Fungus, 11(2), 105-113., Doi: 10.30708.mantar.673175 (Alan endeksi)

Bilimsel Projeler (Son 5 Yıla Ait)

Uzak Doğu Asya Ve Uzak Batı Asya Arasındaki Benzer Konak Liken Soyundan İzole Edilen Endolikenik Mantarların (Elf) Biyoçeşitliliği, TÜBİTAK (221N004), Uluslararası İkili İşbirliği Programları, Araştırmacı: BURHAN ŞEN, 2022- Devam Eden Proje

Türkiye'nin Farklı İllerindeki Bazı Lokasyonlardan Alınan Toprak Örneklerinde Bulunan, Isıya Dayanıklı Paecilomyces ve Yakın Cinslerine Ait İzolatların Polifazik Taksonomisi, -Tübitak 1001, Yürütücü:BURHAN ŞEN, 2023- Devam Eden Proje (TÜBİTAK 123Z038)

Spor Oluşturmayan Küflerin Doğru ve Hızlı Tanımlanması için MLSA ile MALDI-TOF MS ve FT-IR Veri Tabanlarının Geliştirilmesi ve Metabolit Profillerinin Belirlenmesi, -Tübitak 1001,  Araştırmacı:BURHAN ŞEN, 2023- Devam Eden Proje  (TÜBİTAK-122Z256)

Türkiye’nin Toprak Kaynaklı Isıya Dirençli Aspergillus Cinsi Üyelerinin Polifazik Taksonomisi (118Z359), -Tübitak 1001, Araştırmacı:ŞEN BURHAN, 2018 - 2022. (Sonuçlanmış Proje 118Z359)

Meşelerde görülen Armillaria spp. ve Phytophtora spp. hasarına karşı Trichoderma viride ile biyolojik mücadele yapılması Yumurtatepe örneği (Proje No: 10.4801/2014-2019/2020), Diğer kamu kuruluşları (Yükseköğretim Kurumları hariç), Araştırmacı:BURHAN ŞEN, 2014-2021 (ULUSAL-Marmara Ormancılık Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü)

Kırklareli, Edirne ve Tekirdağ illerindeki yumurtacı tavuk altlıklarından elde edilen Salmonella izolatlarının serotiplendirilmesi, farklı kimyasal yapılara sahip dezenfektanlar ile antibiyotik ve gümüş nanopartiküllerine olan duyarlılıklarının belirlenmesi, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi (TÜBAP), Yürütücü;Burhan ŞEN, 2022- Devam Ediyor

Klinik Açıdan Önemli Bazı Trichophyton Türlerinin Hızlı Tespiti için Multiplex Real-Time PCR Temelli Bir Yöntem Geliştirilmesi, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi (TÜBAP), Yürütücü;Burhan ŞEN, 2018 - 2021

Modifiye besiyerlerinde üretilen Penicillium ve Talaromyces cinslerine ait bazı standart suşların süpernatant biyoaktivitelerinin değerlendirilmesi, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi (TÜBAP), Araştırmacı; Burhan ŞEN, 26/10/2022-2024

Üzümlerden İzole Edilen Aspergillus spp. İzolatlarının Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması ve Okratoksin Üretim Potansiyellerinin Belirlenmesi. Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi, Araştırmacı: Burhan ŞEN. FBA-2019-3028. 2019-2021.

Çiğ Süt ve Geleneksel Peynirlerde Staphylococcus aureus Tespiti ve Antibiyotik Direncinin, Enterotoksin Genlerinin Varlığının ve Biyofilm Oluşturma Özelliklerinin Belirlenmesi, Trakya Üniversitesi Araştırma Fonu, Proje no: 2024/111, Yürütücü: Deniz YÜKSEL YENCE 2024-devam ediyor

Cotinus coggygria Scop. bitki ekstrelerinden nano/mikro partiküllerin hazırlanması ve in vivo Caenorhabditis elegans modelinde antimikrobiyal etkilerinin araştırılması, Trakya Üniversitesi Araştırma Fonu, Yürütücü: Deniz YÜKSEL YENCE, 2021-2023

Tripleurospermum callosum (Boiss. & Heldr.) E. Hossain bitki ekstrelerinin in vivo Caenorhabditis elegans modelinde antimikrobiyal etkilerinin araştırılması. TÜBİTAK-3501 Araştırıcı: Deniz YÜKSEL YENCE. 2019-2022

Edirne ilindeki tüketime hazır gıdaların mikrobiyolojik olarak incelenmesi ve bu gıdalarda Listeria monocytogenes ve Staphylococcus aureus’un varlığının, antibiyotik duyarlılık profillerinin ve virülens faktörlerinin araştırılması. Trakya Üniversitesi Araştırma Fonu, Proje No: 2018/90 Yürütücü: Deniz YÜKSEL YENCE. 2018-2021