Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji

Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 2009 yılında kurulmuştur, 2010 yılında faaliyete geçmiştir ve halen Fen Fakültesi bünyesinde çalışmalarını sürdürmektedir. Anabilim Dalı Başkanlığı’nı kuruluşundan itibaren Prof. Dr. Ece ŞEN yürütmektedir. Anabilim Dalında görev yapan 1 öğretim üyesi (Prof.. Dr. Ece ŞEN) ve 1 öğretim elemanı ( Araş. Gör. Dr. Deniz AKSOY) bulunmaktadır.

Araştırma Alanlarımız:

Moleküler Mikrobiyoloji, Mikrobiyal Genetik, Mikrobiyal Biyoteknoloji, Mikroorganizmalarda filogenetik analiz ve tür tayini.

Araştırma Konularımız:

Yeni çıkan zoonoz etkeni bakterilerin (Borrelia sp., Leptospira sp., Anaplasma sp.) moleküler epidemiyolojisi,

Çevresel kanserojenlerin bakteriyolojik Ames testi ile saptanması,

Bakteri-kanser ilişkilerinin moleküler analizi,

Salmonellozlar ve moleküler identifikasyonları,

Çevresel sulardaki yeni çıkan patojenler ve moleküler identifikasyonları,

Su kirliliğinin belirteci olan yeni mikroorganizmaların etkinliğinin incelenmesi

DNA çipleri ile hızlı tanı yöntemlerinin geliştirilmesi

 Mikrobiyal İnsektisitler

Kene kökenli yeni çıkan patojenler

Kenelere karşı biyolojik savaş yöntemlerinin geliştirilmesi.

Kuruluşumuzdan beri Anabilim Dalımızda Yapılan Projeler:

1.Edirne İli nde Bulunan Dermacentor marginatus ve Hyalomma aegyptium Türü Sert Kenelerin in vitro Biyojenik Aktivitelerinin Araştırılması, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi, Yürütücü:ŞEN ECE, , 01/04/2014 - 01/05/2017 (ULUSAL) .Tamamlandı.

2.Escherichia coli O157:H7 ve Salmonella spp. Türlerinin Gıdalardan İzolasyonlarının Geliştirilmesi, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi, Yürütücü:ŞEN ECE, , 02/04/2018 (Devam Ediyor) (ULUSAL)

3.Bakterilerin antitümörojenik aktiviteleri, Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi, Yürütücü, , 01/04/2014 - 01/05/2017 (ULUSAL) Tamamlandı.

4.Salmonella Spp  Kökenlerinin Patogenez Determinantları Ve Salmonellozların Moleküler Tanısında Kullanımları, ARAŞTIRMA PROJESİ, Yönetici, , 01/04/2014 - 01/04/2016 (ULUSAL).Tamamlandı.

5.Kene Ve Tarla Faresi Kökenli Patojen Spiroketlerin Soyutlanması Biyolojik Ve Kimyasal Yeni İnsektisidlerin Kenelere Ve Spiroket Transmisyonuna Etkilerinin Araştırılması, ARAŞTIRMA PROJESİ, Yönetici, , 01/04/2014 - 01/08/2016 (ULUSAL) Tamamlandı.

6. Edirne İlindeki Çevresel Sular Ve İçme Kullanma Sularının Bakteriyolojik Ames Testi İle Mutajenitelerinin Araştırılması, ARAŞTIRMA PROJESİ, Yönetici.(ULUSAL)Tamamlandı 01/09/2016) 01/09/2016 (ULUSAL).Tamamlandı

7.İçme Sularında Termofilik Campylobacter Türlerinin Araştırılması ARAŞTIRMA PROJESİ, (ULUSAL) Yönetici.Tamamlandı.(2020)

Yayınlar (SCI, SCI-EXP) :

1.AKSOY DENİZ,ŞEN ECE (2018).  Salmonella enterica Plazmitlerinin Antibiyotik Duyarlılığı ve Caenorhabditis elegans Patojenitesindeki Rollerinin Belirlenmesi.  Mikrobiyoloji Bulteni, 52(1), 80-88., Doi: 10.5578/mb.60767 (Yayın No: 4720389)(SCI-EXP)

2.Aksoy, D.ve  E.Şen. Investigation of Pathogenic Phenotypes and Virulance Determinants of Food-borne Salmonella enterica Strains in Caenorhabditis elegans Animal Model. Microbiol. Bull.2015., 49(4):513-524. (SCI-EXP)

3.KAZAR Gamze,ŞEN ECE (2016).  Investigation of Antitumorigenic Effects of Food Borne Non Pathogenic and Pathogenic Salmonella enterica Strains on MEF  DU145 and HeLa Cell Lines.  Mikrobiyoloji Bulteni, 50(3), 382-391., Doi: 10.5578/mb.26554 (Yayın No: 2841269)(SCI-EXP)

4.Sakakibara Keiko,ŞEN ECE,Sato Kozue,Kawabata Hiroki,Ohashi Norio,Masuzawa Toshiyuki (2016).     Detection and Characterization of the Emerging Relapsing Fever Pathogen  Borrelia miyamotoi       from the  Ixodes ricinus  Tick in  Rural Trakya  Thrace  Region of Northwestern Turkey  .  Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 16(12), 797-799., Doi: 10.1089/vbz.2016.2012 (Yayın No: 3330521)(SCI)

Bitirilen Doktora Tezleri:

2020

ÖZGÜR MÜJDAT,  İçme Sularında Termofilik Campylobacter Türlerinin Araştırılması, Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoteknoloji ve Genetik Anabilim Dalı. Dr. Tamamlandı.       

2019                                     

 SOYLU HATİCE, (2019). Edirne ilinde bulunan dişi Rhipicephalus sanguineus kompleks (Acari: Ixodidae) kenelerinin bazı biyolojik aktivitelerinin incelenmesi, Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoloji Anabilim Dalı. Tamamlandı.

Yüksek Lisans Tezleri:

2018                     

DOĞRU SÜLEYMAN, (2019). Edirne ve çevresinde Leptospira cinsi bakterilerin araştırılması., Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoloji Anabilim Dalı. Yüksek Lisans.Tamamlandı   

TERZİ SEVDA, (2018-). Escherichia coli O157:H7 ve Salmonella spp. Türlerinin Gıdalardan İzolasyonlarının Geliştirilmesi, Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoteknoloji ve Genetik Anabilim Dalı. Devam ediyor

  BULUT HAKAN, (2019-). Biyoçözünür Atıklar Kullanılarak İnsektisidal Toksinlerin Üretimi, Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoloji Anabilim Dalı.

 AKGÜL TUĞÇE, (2018-). Edirne'de  Dondurmanın Bakteriyolojik Kalitesinin Belirlenmesi, Trakya Üniversitesi->Fen Bilimleri Enstitüsü->Biyoteknoloji ve Genetik Anabilim Dalı.

ÖZEN BÜŞRA, (2018- ) Edirne İli ve Çevresindeki Artropodların Antimikrobiyal Kimyasalları ve Aktiviteleri, TRAKYA ÜNİVERSİTESİ/FEN FAKÜLTESİ/BİYOLOJİ BÖLÜMÜ/TEMEL VE ENDÜSTRİYEL MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI.      

Laboratuvar Donanımımız:

Biyolojik emniyet kabini, PZR cihazı (Gradyan), horizontal midi jel elektroforez cihazı, güç kaynağı, inkübatör, koloni sayacı, Ph metre, mikrosantrifüj, vorteks, sıcak su banyosu, elektrikli insineratör/sterilizatör, PZR sterilizasyon kabini, immünoblotting transfer cihazı, steril hücre kültürü ve biyolojik emniyet düzeyi 2 izolasyon odası. , invert faz kontrast ışık mikroskopu, karanlık alan ışık mikroskopu ve  kamera/video ataçmanları, karbondioksitli etüv, bakteriyolojik etüv (Cihazlar TÜBAP Projeleri desteği ile alınmıştır.), HEPA filtreli deney hayvanı kafes sistemleri,

Anabilim Dalımız Tarafından Açılan Dersler:

Lisans:

Genel Mikrobiyoloji II

Genel Mikrobiyoloji II Laboratuvarı

Moleküler Evrim

Mikrobiyal Ekoloji

Viroloji

Biyoteknolojiye Giriş

Moleküler Mikrobiyolojiye Giriş

Y.Lisans:

Su Mikrobiyolojisi

Moleküler Mikrobiyoloji

Endüstriyel Mikrobiyoloji

Mikrobiyal Teknoloji

Doktora:

İleri Biyoteknoloji

İleri Moleküler Mikrobiyoloji

Uygulamalı Mikrobiyal Genetik

Fakülte Dersleri:

Biyoteknoloji

Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar (GDO)

Sağlık Bilimleri Enstitüsü Doktora Dersi:

Moleküler Mikrobiyoloji ve Uygulamaları